2013年1月10日，環保部發布《關于同意建設國家環境保護環境監測質量控制重點實驗室的復函》（環函[2013]7號），同意以中國環境監測總站為依托單位，建設國家環境保護環境監測質量控制重點實驗室。
重點實驗室建設期為兩年，其任務為：面向國家環境保護戰略需求，圍繞國家環境監測網質控技術、實驗室分析質控技術、水質自動監測質控技術、空氣自動監測質控技術、污染源在線監測質控技術、近岸海域監測質控技術、噪聲與振動監測質控技術、質控技術驗證與示范等方向，開展環境監測質量控制的基礎理論與方法研究，發展若干環境監測質量控制關鍵技術，培育一支高水平的創新研發團隊，構建國家環境監測質量控制應用示范平臺，為我國環境監測的質量控制提供強有力的決策技術支持。
